تنش‌ها زمانی بالا می‌گیرد که یک پزشک (دانیل ورونزه) پسر نوجوانش را تحت فشار قرار می‌دهد تا راه او را دنبال کند.

پاتاگونیا روایتگر سفر دو زن است؛ یکی به دنبال گذشته‌اش و دیگری در جستجوی آینده‌اش. فیلم بین داستان‌های آن‌ها جابه‌جا می‌شود؛ جایی که یکی از آن‌ها در بهار ولز از جنوب به شمال سفر می‌کند و دیگری در پاییز آرژانتین از شرق به غرب می‌رود.