بر اساس یک رویداد واقعی، فیلم «عفو» داستان تراژیکومیک سه دوست را روایت می‌کند که به اشتباه به عنوان اعضای یک سازمان تروریستی شناخته شده و سر از زندان درمی‌آورند. ترس ابراهیم از لباس‌های فرم باعث می‌شود هر وقت مأموری را می‌بیند فرار کند. به همین دلیل، پلیس او را با یک تروریست اشتباه می‌گیرد و او و دوستش موزو را بازداشت می‌کند. آن‌ها که در طول بازجویی فریب پلیس را خورده‌اند، به امید نجات خود، نام دوست دیگرشان آیدین را لو می‌دهند. وقتی همگی در زندان بند می‌شوند، به یاد خانواده‌ها و معشوقه‌هایی می‌افتند که پشت سر گذاشته‌اند.